Explicado: variante B.1.617 y el aumento de Covid-19 en India
Los datos de secuenciación del genoma han presentado evidencia del 'doble mutante' en el 61% de las muestras en Maharashtra. Pero solo se puede decir si esta nueva variante está impulsando el aumento continuo de la India después de que haya más datos disponibles.
Los trabajadores de la salud preparan camas en Shehnai Banquet Hall en Nueva Delhi, que se ha convertido en una sala temporal para pacientes con Covid-9. (Foto exprés: Amit Mehra) Durante una reunión con los laboratorios del distrito en Maharashtra la semana pasada, el Instituto Nacional de Virología (NIV) compartió datos limitados que muestran una ruptura de 361 muestras secuenciadas del genoma recolectadas entre enero y marzo de este año.
El hallazgo del titular de el analisis : se detectó la presencia de una doble mutación en 220 - casi el 61 por ciento - de las muestras. Esta doble variante fue clasificada la semana pasada como variante B.1.617.
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¿Qué es el B.1.617?
La variante B.1.617 de SARS-CoV-2 porta dos mutaciones, E484Q y L452R. Ambos se encuentran por separado en muchas otras variantes de coronavirus, pero se han informado juntos por primera vez en la India.
Las dos mutaciones se encuentran en la proteína de pico del virus. La proteína de pico ayuda al virus a unirse a los receptores de la célula humana y obtener la entrada a la célula huésped.
La mutación E484Q es similar a E484K, una mutación que se encuentra en las variantes del coronavirus del Reino Unido (linaje B.1.1.7) y Sudáfrica (B.1.351).
La mutación L452R se ha encontrado en variantes de propagación rápida en California (B.1.427 y B.1.429). Puede aumentar el poder de unión de las proteínas de pico con los receptores ACE2 en las células humanas, haciéndolas más transmisibles. L452R también puede potenciar potencialmente la replicación viral.
Juntos, E484Q y L452R son más infecciosos y pueden evadir los anticuerpos.
¿Dónde se ha encontrado el B.1.617?
Hay datos limitados. Se informó por primera vez desde Maharashtra. En enero, se secuenciaron 19 muestras de varios distritos y se encontró B.1.617 en cuatro. En febrero, se secuenciaron 234 muestras de 18 distritos y 151 muestras, de al menos 16 distritos, tenían esta variante. Y en marzo, hasta 65 de 94 muestras lo tenían.
Hasta ahora, los distritos de Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad y Chandrapur han presentado pruebas contundentes de la presencia de B.1.617. Se secuenciaron menos muestras en otros distritos y la variante se encontró en algunos. La secuenciación está pendiente para más muestras.
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¿Es esta variante más virulenta?
Hasta el momento no hay evidencia. La mayoría de los pacientes pueden hacerlo con el aislamiento domiciliario, aunque la experiencia clínica debe combinarse con datos de secuenciación del genoma para generar evidencia científica. Las anécdotas clínicas de los médicos sugieren que la variante se propaga más rápido, es más infecciosa, puede infectar a familias enteras, pero es menos virulenta y no causa dramáticamente más hospitalizaciones.
La mayoría de los pacientes están asintomáticos y esa es una buena indicación. Pero en números absolutos, tantos casos han representado una carga para la infraestructura de salud, dijo el Dr. Shashank Joshi, experto del Grupo de Trabajo Covid de Maharashtra.
¿Cuánto se ha extendido?
El Dr. Sujeet Singh, director del Centro Nacional para el Control de Enfermedades (NCDC) ha señalado que hasta ahora se han secuenciado muy pocas muestras de Maharashtra, y es demasiado pronto para sacar conclusiones definitivas sobre cuán extendido está el doble mutante. Sin embargo, el gobierno central informó en marzo que entre el 15% y el 20% de las muestras en Maharashtra tenían esta variante; Sobre la base de los últimos datos de secuenciación, sabemos que este número supera actualmente el 60%.
Los médicos y administradores de distrito en Maharashtra informan que, a diferencia de la primera ola, familias enteras se infectan en la segunda ola. Esto podría indicar que las medidas de distanciamiento físico y aislamiento son inadecuadas en el hogar o que el virus se ha vuelto más transmisible.
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¿Podría B.1.617 estar impulsando el aumento continuo de casos de Covid-19?
El Dr. Gangandeep Kang, profesor de microbiología en el Christian Medical College, Vellore, dijo que el 60,9 por ciento de las muestras que portaban esta variante probablemente mostraban un vínculo entre la mutación y el aumento; sin embargo, para una respuesta precisa, al menos el 1 por ciento de las muestras de Covid-19 debe ser secuenciado cada semana. Con la India en la actualidad probando más de 1 lakh de casos al día, y esto se traduciría en aproximadamente 1,000 secuencias del genoma todos los días.
También debemos observar cuántas personas puede infectar una persona y el umbral del ciclo de RT-PCR. Necesitamos hacer un seguimiento en vivo. Los datos de enero tienen poco valor en abril, dijo el Dr. Kang.
El Dr. Gautam Menon, profesor de la Universidad de Ashoka, Sonepat, y del Instituto de Ciencias Matemáticas, Chennai, dijo: Lo que tenemos es sugerente, pero necesitamos más datos de secuenciación del genoma para comprender qué variante está impulsando el número de nuevas infecciones en diferentes estados ... Para sugerir que el aumento de casos se debe a esta variante de doble mutante, deberíamos tener más puntos de tiempo. Por ejemplo, si pudiéramos decir que detectamos el 30 por ciento de esta variante en muestras el 30 de marzo, y luego el 40 por ciento en muestras el 14 de abril, eso indicaría que la nueva variante está dominando la propagación de la enfermedad.
El Dr. Menon también subrayó la necesidad de una mayor transparencia de los datos. Es posible, aunque cada vez más improbable, que los casos también estén relacionados con la cepa anterior, dijo. A menos que sepamos en qué medida el aumento se puede atribuir a la nueva variante, no podremos determinar de manera concluyente si las relajaciones en el comportamiento apropiado de Covid con la cepa más antigua impulsaron los aumentos o si el aumento de la infectividad de la nueva variante es responsable.
El profesor Vinod Scaria, científico principal de CSIR -IGIB, estuvo de acuerdo en que no podemos decir de manera concluyente que estas variantes estén impulsando el aumento en la segunda ola. Sin embargo, la evidencia sugiere que al menos en algunos estados, el linaje B.1.1617 es predominante y podría estar contribuyendo al aumento de casos, dijo. Este linaje está definido por 15 variantes genéticas, incluidas seis variantes de proteínas de pico. Dos de estos (E484Q y L452R) están involucrados en el escape inmunológico, así como en el aumento de la infectividad, dijo el profesor Scaria.
¿Puede la variante evadir las vacunas?
Nuevamente, los datos son limitados. De hecho, algunas personas se han infectado después de la primera dosis, pero no hay datos sobre si sus muestras se enviaron para secuenciar el genoma.
Sabemos que la variante sudafricana es más capaz de escapar de la respuesta inmune. Sabemos que la variante del Reino Unido es la más transmisible. Pero no sabemos nada sobre B.1.617 hasta ahora, porque no estamos reuniendo datos para sacar conclusiones, dijo el Dr. Kang.
El Dr. Menon subrayó que, si bien no se espera que las vacunas prevengan la infección, ciertamente previenen enfermedades graves y la muerte. Esperamos que esto siga siendo cierto incluso con la nueva variante. La única solución a mediano y largo plazo para lidiar con Covid-19 es que las personas se vacunen.
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