Explicado: La mutación de virus y la nueva variante de Covid-19 en Reino Unido
Las variantes de SARS-CoV-2 del tipo del Reino Unido de rápida propagación también podrían desarrollarse de forma independiente en la India. La ignorancia no puede ser dicha. Un elemento básico de la vigilancia de enfermedades es la cobertura y la densidad adecuadas para detectar eventos antes de que se propaguen ampliamente. Es fundamental realizar una secuenciación mucho mayor del genoma.
Los pasajeros del Reino Unido completan formularios en el Aeropuerto Internacional Chhtrapati Shivaji en Mumbai. (Foto AP / Archivo) El año 2020 será recordado por la aparición de un nuevo virus: el coronavirus 2 del SARS (SARS-CoV-2) y la pandemia Covid-19 que causó. Con unos días más para el final, se proyecta que 2020 se cerrará con alrededor de 84 millones de casos confirmados de Covid-19 y más de 1.8 millones de muertes.
A pesar de esta tristeza, este también ha sido un año de esperanza, con el desarrollo, prueba y aprobación de vacunas. a una velocidad notable . Por primera vez en la historia, una pandemia de enfermedades humanas se controlaría mediante vacunas en tiempo real.
El premio Nobel Joshua Lederberg, uno de los pensadores más influyentes de la biología moderna, dijo una vez: La mayor amenaza para el dominio continuo del hombre en el planeta es el virus. Dos desarrollos recientes nos recuerdan por qué los virus pueden ser adversarios tan formidables.
Con el descubrimiento de 58 personas que dieron positivo por el nuevo coronavirus en la Antártida , la pandemia ha llegado a todos los continentes. Y un virus mutante ha surgido en el Reino Unido, que amenaza con cerrar el mundo una vez más, un mundo que apenas comienza a recuperarse de los bloqueos y las restricciones de movimiento.
La mutación de virus
El material genético o genoma del SARS-CoV-2 es un ácido ribonucleico (ARN) compuesto por más de 30.000 unidades (llamadas nucleótidos). Entre las familias de virus de ARN, los coronavirus tienen el genoma más grande. La mayoría de los demás virus de ARN tienen una media de unos 10.000 nucleótidos. Cuando los genomas se replican, cualquier genoma, ya sea ADN o ARN, desde los virus más pequeños hasta los humanos, hay errores aleatorios (o mutaciones). Si bien los organismos superiores tienen la maquinaria para corregir estos errores, los virus y especialmente los de ARN no la tienen.
La mayoría de las mutaciones son perjudiciales y esos virus nunca se ven. Solo las mutaciones que ofrecen alguna ventaja selectiva dan como resultado la evolución de nuevas variantes virales.
La evolución también requiere presión de selección. Para un virus, esto podría ser su capacidad para infectar mejor y multiplicarse en mayor número o evadir la inmunidad del huésped. La baja probabilidad de estos eventos se compensa con las altas tasas de multiplicación del virus. Por ejemplo, cada célula infectada con coronavirus produce alrededor de 1.000 nuevas partículas de virus en menos de 12 horas.
El mutante en el Reino Unido
Recientemente se descubrió en el Reino Unido un grupo o linaje filogenético distinto (denominado B.1.1.7) de SARS-CoV-2. Los dos primeros virus de este linaje se recolectaron el 20 y 21 de septiembre en Kent y Greater London, respectivamente. Para el 15 de diciembre, este linaje contenía 1.623 virus: 555 de Kent, 519 del Gran Londres, 545 en otras regiones del Reino Unido, incluidas Escocia y Gales, y cuatro de Australia, Dinamarca, Italia y Países Bajos.
En otros diez días, el 25 de diciembre, el número de estas variantes de virus se ha más que duplicado a 3.575; principalmente del Reino Unido, pero ahora también de Francia, Irlanda, Israel, Hong Kong y Singapur.
| Coronavirus mutado frente a pruebas y vacunas
Que hace la mutación
En comparación con las cepas originales de SARS-CoV-2, los virus de este linaje han acumulado 23 mutaciones en 5 genes. De estos, hay 17 mutaciones no sinónimos y seis sinónimas; el primero también cambia un aminoácido en ese sitio de la proteína. Es importante destacar que, de las 17 mutaciones no sinónimas, ocho se encuentran en la proteína de pico, la proteína que permite que el virus se adhiera a las células y entre en ellas.
La mutación N501Y en uno de los residuos de contacto clave en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína pico aumenta su afinidad por el receptor ACE2. La mutación P681H en el sitio de escisión entre los dominios S1 y S2 de la proteína espiga promueve la entrada en células susceptibles y aumenta la transmisión en modelos animales de infección.
El cambio de N501Y también se asocia con una mayor infectividad y virulencia en modelos animales. Ambas mutaciones se observaron anteriormente de forma independiente, pero se han unido en los virus variantes del Reino Unido. El resultado es un virus que se propaga más rápido que antes.
El experto
El Dr. Shahid Jameel es uno de los virólogos más conocidos de la India. Actualmente es Director de la Escuela de Biociencias Trivedi en la Universidad de Ashoka, anteriormente trabajó para el Centro Internacional de Ingeniería Genética y Biotecnología con sede en Delhi, y luego se desempeñó como Director Ejecutivo de Wellcome Trust / DBT Alliance, que financia la investigación en salud.
El motivo de preocupación ...
brian quinn 12 monos
Existe una preocupación generalizada de que estas mutaciones puedan evitar que las pruebas que se utilizan actualmente detecten el virus, lo hagan más letal o le permitan evadir las vacunas en desarrollo. Hasta ahora no hay evidencia de ninguno de estos. Después de todo, estas variantes se encontraron en personas que fueron identificadas como positivas con las pruebas RT-PCR disponibles actualmente.
Sin embargo, aunque no hay evidencia de una enfermedad más grave, existe una clara evidencia de que esta variante es más contagiosa. Los infectados producen más virus en la nariz y la garganta, y eso conduce a más diseminación de virus y más transmisión de persona a persona.
Si bien estas variantes no parecen ser más letales, con más personas infectadas habría un mayor número (no porcentajes) de infecciones graves y muertes. Esto debería ser motivo de preocupación.
... Y razón para no
Aunque existen múltiples mutaciones en la proteína de pico, la mayoría de los expertos creen que las vacunas que se encuentran actualmente en desarrollo también funcionarían con los virus variantes. Vineet Menachery, profesor asistente de microbiología e inmunología en la Rama Médica de la Universidad de Texas en Galveston, EE. UU., Ha proporcionado la primera evidencia de esto.
Su laboratorio comparó la eficacia de las muestras de suero de pacientes con Covid-19 recuperados para neutralizar virus con o sin la mutación N501Y. No encontraron diferencia. Aunque solo se compartió en Twitter el 23 de diciembre y aún no forma parte de una publicación, estos resultados son alentadores y tranquilizadores.
Los viajeros miran los paneles de información en la estación de King's Cross, ya que los países de la UE imponen una prohibición de viajar desde el Reino Unido tras el brote de coronavirus, en Londres, Reino Unido, el 21 de diciembre de 2020. (Foto Reuters) Vuela, no mutación
India ha detenido todos los vuelos desde el Reino Unido y ha aumentado la vigilancia en los aeropuertos para detener la importación de variantes altamente transmisibles. Si bien aparentemente es una estrategia razonable, tales variantes también podrían desarrollarse fácilmente dentro del país. Después de todo, India tiene más de 10 millones de infecciones confirmadas y se estima que entre 150 y 200 millones de personas ya están infectadas.
Una variante de propagación rápida llamada 501.V2 surgió de forma independiente en Sudáfrica y comparte la mutación N501Y con las variantes del Reino Unido. Aunque la variante pico N501Y aún no se ha encontrado en India, los virus con la mutación P681H comenzaron a emerger en julio y actualmente el 14% del SARS-CoV-2 que circula en India porta esta mutación.
Estos virus son principalmente de Maharashtra, y algunos también de Bengala Occidental. Solo haría falta una mutación más para llegar a donde está el Reino Unido hoy. Y eso también debería preocuparnos en la India.
La reacción rápida es clave
Para detectar la aparición de nuevas variantes virales antes de que se propaguen ampliamente en la población, la Organización Mundial de la Salud (OMS) recomienda determinar la secuencia genómica del virus de al menos uno de cada 300 casos confirmados (o 0,33%). El Reino Unido ha secuenciado 135.572 o el 6,2% de variantes virales de sus 2,19 millones de casos, mientras que Sudáfrica y EE. UU. Han informado secuencias del genoma del 0,3% de los casos confirmados.
Sin embargo, la India hasta ahora ha secuenciado solo 4.976 o 0.05% de virus de sus más de 10 millones de casos. A este ritmo, permaneceremos ajenos a la aparición de nuevas variantes hasta que ya sea demasiado tarde. Un elemento básico de la vigilancia de enfermedades es la cobertura y la densidad adecuadas para detectar eventos antes de que se propaguen ampliamente.
Una pareja cruza la calle con un paraguas y bolsas de la compra, en Mayfair, antes de las nuevas medidas de restricción de Nivel 4, en Londres, el sábado 19 de diciembre de 2020 (Foto AP). Condiciones propicias para la India
Otro motivo de preocupación es que las condiciones que se supone que darán lugar a la variante del Reino Unido también están presentes en India. Los pacientes inmunodeficientes o inmunosuprimidos, que se infectan crónicamente con SARS-CoV-2, permanecen positivos para el ARN viral durante 2-4 meses en lugar de las 2-3 semanas habituales. Estos pacientes a menudo son tratados con plasma de convalecencia (a veces más de una vez) y generalmente también con el medicamento remdesivir.
La secuenciación del genoma del virus de estos pacientes ha revelado un número inusualmente grande de cambios de nucleótidos. También se sabe que la diversidad genética de virus intrapaciente aumenta después de la terapia con plasma. El estado nutricional deficiente es una causa conocida de la debilidad del sistema inmunológico y los médicos de la India han informado de infecciones crónicas en un subconjunto de pacientes.
Quedan varias incógnitas
La terapia con plasma y el remdesivir también se han utilizado ampliamente para tratar a los pacientes con Covid-19 en la India. Además, se ha administrado plasma en la India sin antes realizar pruebas de los niveles de anticuerpos neutralizantes. Todo esto crea oportunidades para que surjan variantes del tipo del Reino Unido también en India. Pero no hemos secuenciado lo suficiente para saber si eso ha sucedido.
Incluso con una cobertura baja, las secuencias de la India están sesgadas para ubicaciones urbanas, especialmente las áreas metropolitanas donde se encuentran los laboratorios de secuenciación. Esto necesita una cobertura más amplia para incluir todas las partes del país. El Consejo Indio de Investigación Médica puede facilitar este proceso al brindar acceso a muestras de pacientes con Covid-19 a laboratorios de investigación que tengan la capacidad de secuenciación genómica y análisis de datos. La vigilancia en tiempo real proporcionará datos densos y granulares para establecer políticas basadas en evidencia.
India ha detenido todos los vuelos desde el Reino Unido y ha aumentado la vigilancia en los aeropuertos para detener la importación de variantes altamente transmisibles. (Foto exprés: Partha Paul) Avanzando con 'SMS'
Cuando las vacunas se desplieguen más ampliamente, habrá más presiones de selección sobre el virus para que cambie. Los mutantes de escape de la vacuna son bien conocidos para otros virus y también surgirán para el SARS-CoV2. Solo una vigilancia genética adecuada detectará a tiempo cualquier falla de la vacuna.
A medida que avanzamos hacia 2021, el mensaje para los responsables políticos y el público es claro. Quienes supervisan la salud pública deben buscar continuamente nuevas pruebas para formular políticas a nivel de la población. A nivel individual, cada uno de nosotros debe trabajar para reducir la transmisión del virus: menos transmisión significa menos oportunidades para que el virus cambie. Y SMS es la única herramienta disponible para nosotros en este momento: distanciamiento social , mascarillas y desinfección.
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