Nueva investigación: identificación de objetivos potenciales para medicamentos que podrían funcionar contra todos los coronavirus
Los medicamentos a menudo se unen a los bolsillos internos de las proteínas que lo sujetan firmemente, lo que hace que interfiera con la función de la proteína. Los científicos pueden identificar posibles bolsas de unión a fármacos a partir de las estructuras tridimensionales de las proteínas virales.
Han publicado sus hallazgos en el Journal of Proteome Research de la American Chemical Society. La posible aparición de variantes del SARS-CoV-2 resistentes a las vacunas, así como de nuevos coronavirus, hace que sea importante encontrar tratamientos que funcionen contra todos los coronavirus.
Ahora, los investigadores han analizado proteínas virales en 27 especies de coronavirus y miles de muestras de pacientes con Covid-19, identificando secuencias altamente conservadas que podrían ser las mejores dianas farmacológicas. Han publicado sus hallazgos en el Journal of Proteome Research de la American Chemical Society.
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Los medicamentos a menudo se unen a los bolsillos internos de las proteínas que lo sujetan firmemente, lo que hace que interfiera con la función de la proteína. Los científicos pueden identificar posibles bolsas de unión a fármacos a partir de las estructuras tridimensionales de las proteínas virales. Sin embargo, con el tiempo, los virus pueden mutar sus bolsas de proteínas para que los medicamentos ya no encajen.
Pero algunas bolsas de unión a fármacos son tan esenciales para la función de la proteína que no se pueden mutar, y estas secuencias generalmente se conservan con el tiempo en el mismo virus y en virus relacionados.
En el estudio, el investigador Matthieu Schapira y sus colegas querían encontrar los bolsillos de unión a fármacos más conservados en proteínas virales de muestras de pacientes con Covid-19 y de otros coronavirus, revelando los objetivos más prometedores para los medicamentos contra el pan-coronavirus, dijo la Sociedad Química Estadounidense. en un comunicado de prensa sobre la investigación.
El equipo utilizó un algoritmo informático para identificar bolsas de unión a fármacos en las estructuras 3D de 15 proteínas del SARS-CoV-2. Luego, los investigadores encontraron las proteínas correspondientes en 27 especies de coronavirus y compararon sus secuencias en los bolsillos de unión al fármaco.
Los dos sitios farmacológicos más conservados involucraban proteínas (llamadas nsp13 y nsp12 respectivamente) que están involucradas en la replicación y transcripción del ARN viral.
Los investigadores dijeron que los nuevos medicamentos antivirales que se dirigen al sitio catalítico de la proteína nsp12 se encuentran actualmente en ensayos clínicos de fase II y III para Covid-19, y que el sitio de unión del ARN de nsp13 es un objetivo previamente subexplorado que debería ser una alta prioridad para el desarrollo de medicamentos. .
Fuente: American Chemical Society
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